在決策層級方面，由「理事長」領導理監事們組成核心決策團隊，負責制定協會發展方向與重大政策；由「秘書室」負責日常會務及會員服務，業務執行層面則設有「執行長」統籌發展性的開發工作及例行性業務，並確保決策能依計畫期程有效落實。
功能部門劃分細緻且具針對性，設有「業務組」、「教育組」、「行銷組」與「總務組」四大組別。其中「業務組」負責「聯盟發展」擔任勸募與尋覓合贊夥伴；學程規劃專注於對外合作與教育體系建置；「教育組」負責「學程規劃」辦理演講、研修或交流等活動；「行銷組」負責「內容產出」透過文宣、行銷及公關以提升提升協會影響力；「總務組」及「會務組」則涵蓋行政、財會、庶務，以及會招募與會員服務。經由這五個分組的分工合作，以確保協會的會務及業務運作順暢。
台灣人工智慧應用交流協會組織圖
